企業所得稅備案的注意事項主要在于企業應當根據所享受的稅收優惠項目備案留存相應的紙質版資料和電子版資料。關于稅收優惠事項所需備案留存的資料納稅人可以通過查看《企業所得稅優惠事項管理目錄》或咨詢所屬地區的主管稅務機關了解。
而根據《企業所得稅優惠政策事項辦理辦法》的規定，企業享受優惠事項采取“自行判別、申報享受、相關資料留存備查”的辦理方式。企業應當根據經營情況以及相關稅收規定自行判斷是否符合優惠事項規定的條件，符合條件的可以按照《目錄》列示的時間自行計算減免稅額，并通過填報企業所得稅納稅申報表享受稅收優惠。同時，按照《辦法》的規定歸集和留存相關資料備查。
